2009年10月，壹基金发布了成立以来中国地区财务报告，截至2009年6月30日，30人的工作团队，一共募集约1.7亿人民币，其中个人捐赠约占40%，其余大多是企业捐赠，包括阿里巴巴、恒安集团、汇源集团、百事可乐、东风标致等各个领域企业。因汶川地震而接受的专项捐赠超过1.2亿，真正的日常公益募捐，事实上仍然不到5000万，截至2009年6月30日，结余只有不到3000万。
以企业捐赠为主的现实，与壹基金重点努力拓展个人捐赠的渠道和资源的理想背离，虽然壹基金当时受捐的个人比例达到40%以上，远高于中国20%的平均水平。
另一方面，壹基金还有一个重要使命，是希望成为中国本土草根NGO成长强有力的孵化器。在被称为中国NGO元年的2008年过后，人们期待基金会与NGO合作时代的到来，本土NGO面临的资源供应断裂问题并没有得到改善，壹基金每年进行的典范工程评选，每年遴选10家本土公益组织作为典范，各给予100万资助。但这对于众多的本土NGO来说，无异于杯水车薪。
贯彻“人人参与积少成多”的捐赠理念与成为中国本土草根NGO的孵化器，这两个理想在现实的制度安排下都显得举步维艰，比如壹基金希望发展潜力巨大的手机平台的捐款，因为账户的不独立，而在操作上存在重大的不便。而只要可以注册为独立的公募基金会便都可以迎刃而解。因此，这也一直是李连杰致力努力的方向，而在付出各种努力之后，根本问题仍难解决，李连杰忍不住作了次倾述。
去年9月，李连杰做客央视《面对面》称“壹基金可能面临中断”。随后中国红十字会秘书长王汝鹏以问答形式在博客中回应称，壹基金并不存在关闭问题，根据协议约定，3年合约早在去年2月5日就已到期，根据协议约定目前已自动续延因此。李连杰解释说所谓的“中断”主要是一种对制度的无奈：没有独立法人身份、公章和银行账户。
他在受访时称：壹基金就是一个没有身份证的孩子，这三年这孩子起码还健健康康的，没出什么事，“但是他没身份证。已经越来越受到希望中国公益慈善事业更加专业透明化者的质疑。”他甚至说：从05年筹备“壹基金”以来，他一直就是真孙子，遇到重重困难，到处求人，但从未退缩。
此后的《南方周末》披露说，壹基金与红十字会“分手”在去年年初就已经开始酝酿，当年2月份与中国红十字会合约到期后，壹基金便开始在民政部办理公募基金会申请程序，希望给壹基金一个独立合法的身份，但7个月仍然无果。 |
